Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprtQ99M80 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms