Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pagr1aQ99L02 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms