Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2aQ99KJ0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2aQ99KJ0 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms