Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Krcc1Q99JT5 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Krcc1Q99JT5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Krcc1Q99JT5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Krcc1Q99JT5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Krcc1Q99JT5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Krcc1Q99JT5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Krcc1Q99JT5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Krcc1Q99JT5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Krcc1Q99JT5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Krcc1Q99JT5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Krcc1Q99JT5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krcc1Q99JT5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms