Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ttc30a1Q99J38 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ttc30a1Q99J38 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc30a1Q99J38 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ttc30a1Q99J38 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ttc30a1Q99J38 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ttc30a1Q99J38 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ttc30a1Q99J38 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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