Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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