Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Ctu1Q99J10 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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Ctu1Q99J10 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Ctu1Q99J10 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Ctu1Q99J10 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Ctu1Q99J10 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Ctu1Q99J10 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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Ctu1Q99J10 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Ctu1Q99J10 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Ctu1Q99J10 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ctu1Q99J10 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ctu1Q99J10 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ctu1Q99J10 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctu1Q99J10 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ctu1Q99J10 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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