Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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PdgfdQ925I7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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PdgfdQ925I7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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PdgfdQ925I7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PdgfdQ925I7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PdgfdQ925I7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PdgfdQ925I7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PdgfdQ925I7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfdQ925I7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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