Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms