Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Pde6cQ91ZQ1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pde6cQ91ZQ1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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