Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prpf6Q91YR7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf6Q91YR7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms