Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd3Q91W18 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd3Q91W18 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms