Protein–RNA interactions for Protein: Q91V10

Vsx1, Visual system homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Vsx1Q91V10 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx1Q91V10 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Vsx1Q91V10 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vsx1Q91V10 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx1Q91V10 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx1Q91V10 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Vsx1Q91V10 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx1Q91V10 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Vsx1Q91V10 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx1Q91V10 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vsx1Q91V10 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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