Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.5 ms