Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3G9

Tspan8, Tetraspanin-8, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan8Q8R3G9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tspan8Q8R3G9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tspan8Q8R3G9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan8Q8R3G9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tspan8Q8R3G9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tspan8Q8R3G9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tspan8Q8R3G9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan8Q8R3G9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan8Q8R3G9 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tspan8Q8R3G9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tspan8Q8R3G9 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan8Q8R3G9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan8Q8R3G9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan8Q8R3G9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan8Q8R3G9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan8Q8R3G9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan8Q8R3G9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan8Q8R3G9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan8Q8R3G9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan8Q8R3G9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan8Q8R3G9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan8Q8R3G9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan8Q8R3G9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan8Q8R3G9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan8Q8R3G9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan8Q8R3G9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tspan8Q8R3G9 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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