Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc12Q8R344 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms