Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CcsapQ8QZT2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms