Protein–RNA interactions for Protein: Q8K387

Usp45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp45Q8K387 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp45Q8K387 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms