Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms