Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms