Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sde2Q8K1J5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms