Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI19

Pdgfc, Platelet-derived growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfcQ8CI19 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfcQ8CI19 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfcQ8CI19 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfcQ8CI19 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfcQ8CI19 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfcQ8CI19 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfcQ8CI19 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfcQ8CI19 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfcQ8CI19 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfcQ8CI19 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfcQ8CI19 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfcQ8CI19 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfcQ8CI19 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfcQ8CI19 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfcQ8CI19 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfcQ8CI19 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfcQ8CI19 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfcQ8CI19 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfcQ8CI19 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfcQ8CI19 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfcQ8CI19 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfcQ8CI19 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms