Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc63Q8CDV6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms