Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd4aQ8CBY1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms