Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Atg4aQ8C9S8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Atg4aQ8C9S8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Atg4aQ8C9S8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Atg4aQ8C9S8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Atg4aQ8C9S8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Atg4aQ8C9S8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Atg4aQ8C9S8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Atg4aQ8C9S8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Atg4aQ8C9S8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Atg4aQ8C9S8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg4aQ8C9S8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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