Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
4933409G03RikQ8C5U0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms