Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc113Q8C5T8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc113Q8C5T8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc113Q8C5T8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc113Q8C5T8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc113Q8C5T8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ccdc113Q8C5T8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ccdc113Q8C5T8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ccdc113Q8C5T8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ccdc113Q8C5T8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ccdc113Q8C5T8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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