Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp44Q8C2S0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp44Q8C2S0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp44Q8C2S0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp44Q8C2S0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp44Q8C2S0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp44Q8C2S0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp44Q8C2S0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp44Q8C2S0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp44Q8C2S0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp44Q8C2S0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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