Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nek11Q8C0Q4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek11Q8C0Q4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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