Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccser1Q8C0C4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccser1Q8C0C4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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