Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms