Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms