Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube3dQ8BX13 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ube3dQ8BX13 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube3dQ8BX13 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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