Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Zfp398Q8BV16 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Zfp398Q8BV16 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Zfp398Q8BV16 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Zfp398Q8BV16 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Zfp398Q8BV16 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Zfp398Q8BV16 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Zfp398Q8BV16 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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