Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gpc2Q8BKV1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gpc2Q8BKV1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gpc2Q8BKV1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gpc2Q8BKV1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gpc2Q8BKV1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc2Q8BKV1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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