Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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