Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jmjd4Q8BFT6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms