Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnf1Q7TSH7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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