Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actn1Q7TPR4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms