Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD3

Robo2, Roundabout homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo2Q7TPD3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Robo2Q7TPD3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Robo2Q7TPD3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Robo2Q7TPD3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Robo2Q7TPD3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Robo2Q7TPD3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Robo2Q7TPD3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Robo2Q7TPD3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Robo2Q7TPD3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Robo2Q7TPD3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Robo2Q7TPD3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Robo2Q7TPD3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Robo2Q7TPD3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Robo2Q7TPD3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Robo2Q7TPD3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Robo2Q7TPD3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Robo2Q7TPD3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Robo2Q7TPD3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Robo2Q7TPD3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Robo2Q7TPD3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Robo2Q7TPD3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Robo2Q7TPD3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Robo2Q7TPD3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Robo2Q7TPD3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Robo2Q7TPD3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Robo2Q7TPD3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Robo2Q7TPD3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Robo2Q7TPD3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms