Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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Trappc6aQ78XR0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Trappc6aQ78XR0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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