Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms