Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms