Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sohlh1Q6IUP1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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