Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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