Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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