Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Krt40Q6IFX3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Krt40Q6IFX3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Krt40Q6IFX3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Krt40Q6IFX3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Krt40Q6IFX3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Krt40Q6IFX3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Krt40Q6IFX3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Krt40Q6IFX3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Krt40Q6IFX3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Krt40Q6IFX3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Krt40Q6IFX3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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