Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nop58Q6DFW4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nop58Q6DFW4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nop58Q6DFW4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nop58Q6DFW4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nop58Q6DFW4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nop58Q6DFW4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nop58Q6DFW4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nop58Q6DFW4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nop58Q6DFW4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nop58Q6DFW4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nop58Q6DFW4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nop58Q6DFW4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nop58Q6DFW4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nop58Q6DFW4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nop58Q6DFW4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nop58Q6DFW4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nop58Q6DFW4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nop58Q6DFW4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nop58Q6DFW4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nop58Q6DFW4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nop58Q6DFW4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nop58Q6DFW4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nop58Q6DFW4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Nop58Q6DFW4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Nop58Q6DFW4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Nop58Q6DFW4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Nop58Q6DFW4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Nop58Q6DFW4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Nop58Q6DFW4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Nop58Q6DFW4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nop58Q6DFW4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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