Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms