Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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